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在探索生命奧秘的征途上,蛋白質-相互作用(PPI)的研究至關重要。傳統的BRET(生物發光共振能量轉移)技術曾是研究細胞動態事件的有力工具,但其應用卻常常受限。
生物發光共振能量轉移(BRET)檢測試劑盒由Promega在20世紀90年代末開發,對于理解細胞動態事件至關重要,特別是蛋白相互作用(PPI)。在BRET中,發光供體的激發態能量可以轉移到受體熒光素,導致受體分子以特征發射波長發出。這些類型的檢測試劑盒迅速成為測量PPI的有用工具,它們不僅被認為是通用的、快速的和生物學上有用的,而且也適合用于PPI調節的活細胞藥物發現的高通量篩選。然而,傳統的BRET技術存在一些局限性:
Promega公司推出的NanoBRET?消除了所有的限制。在NanoBRET?中,可以使用一種新的、效率高得多的供體-受體對來研究PPI(見圖1)。這一新組合包括一個非常亮的熒光素酶(NanoLuc)作為能量供體,以及一個用熒光標記的Halotag融合蛋白作為能量受體。 圖 1. NanoBRET?檢測 A中:使用NanoBRET研究蛋?質A和B之間的相互作用。供體是NanoLuc??蛋?質A融合體,受體是熒光標記的HaloTag??蛋?質B融合體。 B中:顯示了NanoBRET的分離光譜和計算方法。 新的供體(NanoLuc)尺寸小(19kD),發射信號強(460nm發射峰),并且發射光譜較窄,降低了供體信號“溢漏”到受體發射通道的可能性。 選擇紅色熒光素酶作為BRET配體 (618nm發射) 通過共價鍵連接到HaloTag,這允許相當大的光譜分離(超過150nm),從而確保非常高的信噪比。 然而,盡管比典型的BRET檢測方法優越,NanoBRET的性能仍然取決于選擇合適的酶標儀。Promega強烈建議使用能夠測量雙濾光片波長的儀器,Thermo Scientific Varioskan LUX多功能酶標儀具備測量雙濾光片波長的能力,非常適合進行NanoBRET?檢測。 選擇次優濾光片可能會損害試驗性能并降低數據質量。根據Promega的說法,理想情況下供體信號應該用中心波長為460nm的帶通濾光片(BP)和一個從600-610nm開始的長通濾光片(LP)來測量,以收集所有受體發射信號。使用適當的LP濾光片收集受體信號對于確保檢測試劑的靈敏度尤為重要。 96孔板和384孔板,1X PBS/0.1%BSA,NanoBRET?控制蛋白組,NanoBRET? Nano-Glo?底物。 用1X PBS/0.1%BSA稀釋NanoBRET Nano-Glo底物,稀釋250倍制備成2X溶液。將不同濃度的反應液每孔加50μl,并加入等量的2X NanoBRET Nano-Glo底物 (50μl)。最后一種試劑用Varioskan LUX添加。在加入底物后10分鐘內,使用Varioskan LUX和選擇的濾光片檢測供體和受體發射光信號。 儀器啟動前,需要安裝適當的濾光片。為此,請按照儀器手冊中的說明將濾光片安裝到Varioskan LUX中。需要注意的是,在安裝F600LP或F610LP濾光片時,即使這些濾光片沒有波長范圍,也必須在Thermo Scientific SkanIt?軟件中定義一個波長范圍,可以設置600-999nm。 添加一個動力學環,選擇總時間(或讀數次數)和動力學間隔。在此測試中,以1分鐘為間隔進行20次讀數。注意:反應開始后的前10分鐘內,受體和供體發射信號的動力學衰減非常顯著(如圖2所示)。然而,供體和受體信號的衰減速度保持不變,因此在較長的測量時間內計算出的NanoBRET比值不會受到影響。 圖2 在本次案例中,在讀數為1時用中高速自動分液50μl NanoBRET Nano-Glo底物。 選擇用于測量NanoBRET的濾光片對,并設置1000毫秒的測量時間,使用自動增益。 注意:通常情況下,改變增益以增強受體發射信號并不能改善NanoBRET結果(改變增益會同時放大信號和背景噪聲)。然而,在受體發射信號飽和的情況下,可以降低增益以獲得非飽和讀數。 在0%濃度(沒有nanoBRET信號)和100%濃度(最大nanoBRET信號)的孔中測量受體和發射光譜。使用波長范圍為400–700nm(以1nm步進),測量時間為100ms。 通過將受體發射信號值除以供體發射信號值(Acceptor Em/Donor Em)來計算每個樣本的NanoBRET比值。 通過從樣品中減去對照(無相互作用)的NanoBRET比值來計算校正后的NanoBRET比值。 對校正后的 NanoBRET 比值與濃度的依賴關系進行線性回歸分析,并計算曲線的斜率。 如果儀器正確地檢測到NanoBRET信號,應該獲得一條線性曲線。使用以下公式計算定量限(LOQ)和檢測限(LOD)。注意:無相互作用對照(下圖)對應于0%濃度樣本。 使用NanoBRET比值的均值和標準差來計算每個濃度篩選窗口系數值(Z’)以評估該檢測方法在各個濃度下的性能: 使用Promega控制蛋白組進行的NanoBRET檢測顯示,在96孔板中,使用兩種不同的發射濾光片收集受體信號時,Varioskan LUX 檢測到的NanoBRET信號保持線性(圖3)。 圖3 當使用波長為600或610nm濾光片收集受體信號時,儀器性能指標LOQ和LOD值也高度相似(表1)。使用Varioskan LUX,兩種情況下的LOQ濃度都在0.2%左右,表明相對于總供體群體,含有0.2%供體受體(BRET)對的樣本從統計上與只含有供體分子的樣本區分開來。 NanoBRET是一種出色的篩選工具。根據這里獲得的結果,還可以得出結論:在1%最大NanoBRET效率下進行篩選優化,無論Varioskan LUX測量時采用哪個NanoBRET受體發射濾光片(600或610nm),都可以產生極好的質量參數(Z' > 0.8)。 當在384孔板中運行時,該分析方法也表現良好。在這種情況下測量的最低檢出限 (LOD) 只輕微增加到0.35%(圖4)。這使得NanoBRET和Varioskan LUX的結合對于大型化學抑制劑篩選受體供體對的檢測非常有用。 圖4 在Varioskan LUX中選擇多重化學發光檢測濾光片,可實現NanoBRET 的性能,這是一種由Promega開發的技術,非常適合對活細胞中的蛋白質相互作用進行動態研究。我們建議使用中心波長約為460nm(發射波長為450nm,帶寬為80nm)的帶通 (BP) 濾光片測量供體發射信號,使用起始波長為600或610nm的長通 (LP) 濾光片測量受體發射信號。